Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samsn1P57725 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms