Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp3P57722 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp3P57722 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcbp3P57722 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms