Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gsc2P56916 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gsc2P56916 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms