Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd38P56528 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd38P56528 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cd38P56528 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms