Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2bP55271 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms