Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab8aP55258 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms