Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp1P55194 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms