Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aqp4P55088 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms