Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn5P54830 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn5P54830 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms