Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Map3k1P53349 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Map3k1P53349 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms