Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1swP51491 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms