Protein–RNA interactions for Protein: P49722

Psma2, Proteasome subunit alpha type-2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma2P49722 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma2P49722 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma2P49722 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms