Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptx3P48759 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptx3P48759 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms