Protein–RNA interactions for Protein: P47993

Xcl1, Lymphotactin, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xcl1P47993 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Xcl1P47993 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Xcl1P47993 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Xcl1P47993 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Xcl1P47993 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Xcl1P47993 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Xcl1P47993 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Xcl1P47993 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Xcl1P47993 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xcl1P47993 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Xcl1P47993 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Xcl1P47993 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Xcl1P47993 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Xcl1P47993 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xcl1P47993 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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