Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg3P47867 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms