Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tjp1P39447 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tjp1P39447 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms