Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Traf2P39429 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Traf2P39429 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms