Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig1P37913 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms