Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab20P35295 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab20P35295 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms