Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab21P35282 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab21P35282 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms