Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh15P33146 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh15P33146 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms