Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Saa4P31532 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Saa4P31532 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms