Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou3f3P31361 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f3P31361 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms