Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc10P31257 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms