Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa2P31245 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms