Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tacr1P30548 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tacr1P30548 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms