Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcdP28867 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms