Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd9P28357 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd9P28357 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms