Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa3P28310 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms