Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LoxP28301 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LoxP28301 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LoxP28301 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms