Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb3P28231 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms