Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb9P28076 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb9P28076 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms