Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2afxP27661 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2afxP27661 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2afxP27661 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2afxP27661 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms