Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo2P25801 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo2P25801 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms