Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccnd1P25322 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms