Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ggta1P23336 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ggta1P23336 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms