Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcb1aP21447 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms