Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb9P20615 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms