Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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NelfeP19426 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms