Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka1P18653 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka1P18653 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms