Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18527 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18527 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18527 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms