Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18525 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18525 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18525 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18525 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18525 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18525 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18525 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18525 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
P18525 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18525 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18525 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18525 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18525 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms