Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd1P13516 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scd1P13516 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms