Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a1P12813 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a1P12813 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms