Protein–RNA interactions for Protein: P12672

Rapsn, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RapsnP12672 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RapsnP12672 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RapsnP12672 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RapsnP12672 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RapsnP12672 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms