Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtcP11725 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtcP11725 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtcP11725 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtcP11725 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OtcP11725 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtcP11725 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtcP11725 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtcP11725 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtcP11725 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtcP11725 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtcP11725 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms