Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Spp1P10923 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spp1P10923 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms