Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Surf1P09925 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms