Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa9P09631 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa9P09631 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274.4 ms