Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxb5P09079 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxb5P09079 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxb5P09079 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxb5P09079 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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